Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
DNMT1P26358 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms