Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCM3P25205 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCM3P25205 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCM3P25205 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCM3P25205 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCM3P25205 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCM3P25205 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCM3P25205 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCM3P25205 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCM3P25205 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCM3P25205 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms