Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms