Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms