Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1P21675 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1P21675 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1P21675 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1P21675 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1P21675 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1P21675 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1P21675 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1P21675 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1P21675 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms