Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT1P21579 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT1P21579 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms