Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms