Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCLP19338 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCLP19338 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCLP19338 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCLP19338 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms