Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGAM1P18669 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGAM1P18669 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms