Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms