Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF3P17036 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms