Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPB42P16452 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPB42P16452 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms