Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms