Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms