Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRG2P13727 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRG2P13727 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRG2P13727 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms