Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms