Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HKR1P10072 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HKR1P10072 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HKR1P10072 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HKR1P10072 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HKR1P10072 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms