Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTAP09496 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTAP09496 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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