Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCAP05165 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCAP05165 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCCAP05165 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCCAP05165 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCAP05165 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCAP05165 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCAP05165 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCAP05165 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCAP05165 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms