Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNTO95613 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNTO95613 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNTO95613 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNTO95613 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNTO95613 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNTO95613 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms