Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE8BO95263 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE8BO95263 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms