Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms