Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP2O75604 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP2O75604 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP2O75604 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP2O75604 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP2O75604 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP2O75604 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP2O75604 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP2O75604 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms