Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF40O75150 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF40O75150 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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