Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLIN1O60240 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLIN1O60240 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms