Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms