Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNB1O43157 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms