Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBDO15205 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBDO15205 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBDO15205 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBDO15205 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBDO15205 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBDO15205 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms