Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1CO15160 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms