Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms