Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBAG9O00559 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms