Protein–RNA interactions for Protein: A6NKN8

PCP4L1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4L1A6NKN8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCP4L1A6NKN8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4L1A6NKN8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms