Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD8B2A6NJW9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms