Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms