Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms