Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms