Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TAC1-202ENST00000346867 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FRG1JP-201ENST00000376334 931 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RCL1-201ENST00000381728 758 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P3-201ENST00000394290 584 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB8-204ENST00000397988 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZRANB2-AS2-203ENST00000415780 249 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP001116.1-201ENST00000421604 762 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PAICSP1-201ENST00000425324 1217 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL359541.1-201ENST00000431097 575 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC244205.2-201ENST00000434790 898 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP000866.3-201ENST00000534607 433 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL357093.2-202ENST00000556942 498 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC138512.1-201ENST00000563190 434 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL161725.1-211ENST00000592805 889 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PCDH18-206ENST00000611581 819 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC108463.3-201ENST00000603748 1482 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LRMP-205ENST00000548766 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC099066.1-201ENST00000428148 534 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SOX2-OT-202ENST00000461063 566 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL35P-201ENST00000466169 292 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 IAH1-205ENST00000482918 863 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms