Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ADAMTS12-203ENST00000504830 8774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 C3P1-202ENST00000497718 4954 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC023154.1-203ENST00000508813 2465 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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