Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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