Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SP140-201ENST00000343805 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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