Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 CASP12-211ENST00000508062 774 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
POLR2AP24928 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC091132.4-201ENST00000587960 2262 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC023154.1-203ENST00000508813 2465 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 HSPD1P6-201ENST00000388967 1683 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL049776.1-201ENST00000624600 2025 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms