Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PTPRMP28827 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CSF2RA-205ENST00000381524 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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