Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms