Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms