Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms