Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCQ9Y266 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms