Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms