Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms