Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms