Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED23Q9ULK4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED23Q9ULK4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms